1、来源不同。动物蛋白来源于禽、畜、鱼类和昆虫等的肉、蛋、奶，特别是蛋制品和乳制品。植物蛋白来源于植物，如谷类、豆类、坚果类等，其中米面类和豆类是主要来源。
2、人体吸收不同。动物蛋白质构成以酪蛋白为主78～85%，其蛋白质的种类和结构更加接近人体的蛋白结构和数量，能更好被人体吸收利用。而植物蛋白的蛋白种类和数量与人体的要求有一定差距，且比较难消化。
3、所含氨基酸种类不同。动物蛋白质所含的人体必需氨基酸种类齐全,一般其氨基酸评分均在0.9～1.0的水平。而大多数植物蛋白缺乏人体必需的氨基酸,因此其氨基酸评分较低,仅为0.3～0.5的水平。因此动物蛋白质比一般的植物性蛋白质更容易消化、吸收和利用,营养价值也相对高些。
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