1、大蝙蝠亚目,体型一般较大。眼大,视觉好,能在弱光下不依赖回声定位飞行。吻较长。以花果为食。仅1科。
2、狐蝠科,有42属166种,分为2个亚科:狐蝠亚科和长舌狐蝠亚科。分布于旧大陆热带、亚热带地区,以东南亚和非洲种类最多。中国有5属7种,见于华南区,包括台湾和海南省。均为植食性,其中大型的种类多以果实为食,小型种类主要食花蜜。夜行性远距离飞行觅食,有时可达15公里。主要靠嗅觉发现食物。仅棕果蝠等少数属有超声定位功能。大型者多聚居,小型者多独栖。终年繁殖,或集中在9-11月间,翌年2月产仔。最多每年1胎,每胎1-2仔。饲养条件下可活20年。
3、小蝙蝠亚目,多数体型较小。眼小,回声定位系统发达。吻较短。以食昆虫为主,少数食花果或吸血。
4、鼠尾蝠科,有1属3种。分布于亚洲南部到非洲北部。无鼻叶的中小型的蝙蝠。最显著的特征是有非常长的尾巴,是所有蝙蝠中尾巴最长者,几乎和身体等长。食虫性。比较适应干旱和半干旱的环境。
5、凹脸蝠科(混合蝠科),仅1属1种,即凹脸蝠(混合蝠)。于1973年发现于泰国西部。体长仅3厘米左右,体重不到2克,是最小的翼手目动物,但翼展却有17厘米。口鼻部略似猪鼻,无鼻叶,耳大而有隆起的耳屏,无尾。以昆虫为食。
6、鞘尾蝠科,有13属46种。广布于世界热带、亚热带地区。无鼻叶,尾部被尾膜包裹而尾尖突出在尾膜上,故名。喉部有可以分泌芳香分泌物的小囊,用以吸引异性。适应多种不同生活环境,但是一般不远离树木,主要食昆虫,有时也食果实作为补充。
7、假吸血蝠科(巨耳蝠科),仅4属5种。分布于非洲至大洋洲。体大,无尾,鼻叶发达,耳大而圆。原认为吸血,因而引人注意,现知其食肉,以其他蝙蝠、蜥蜴、小鼠等为食,故名。
8、菊头蝠科,有10属129种,包括2亚科:菊头蝠亚科(1属63种)和蹄蝠亚科(9属66种)。主要分布于世界热带和亚热带地区,少数分布于温带。因有结构比较复杂的马蹄形鼻叶而得名,蹄蝠类稍弱,从鼻孔而非从嘴中发出声纳,耳朵较大但没有耳屏。常不同种十几只或几十只集群共居一个山洞,季节性出现同性群。不畏光,不甚畏人。捕食蚊、鳞翅目昆虫。
9、兔唇蝠科,仅1属2种。分布于拉丁美洲的。体强壮。兔唇蝠又称猛犬蝠,食鱼蝠,以食鱼著称,是仅有的以鱼为主食的蝙蝠。口鼻部尖而没有鼻叶,耳朵大而有小的耳屏,爪子锋利,可以抓住长达10厘米的小鱼,也能用爪子捕捉昆虫。
10、髯蝠科(妖面蝠科),有2属8种。分布于美国亚利桑那州到巴西之间。无鼻叶,但唇和颊有复杂的皮褶,下唇似盘状膨大,耳很大并有复杂的耳屏。食虫性,其嘴部结构可能有助于捕食昆虫,喜群居,常在洞穴中结成大群。包括妖面蝠属(怪脸蝠属)和裸背蝠属。
11、叶口蝠科,有50属139种,分为8个亚科:叶口蝠亚科、长舌蝠亚科、狭叶蝠亚科、花叶蝠亚科、长舌叶口蝠亚科、短尾叶口蝠亚科、尖皮蝠亚科、吸血蝠亚科。分布于南美洲。鼻叶发达,有耳屏。体型和习性多样化。食性复杂,包括食虫、食果实或花蜜、食肉甚至吸血者。吸血蝠亚科的3种吸血蝠有时也单列为吸血蝠科,是陆生脊椎动物中仅有的吸血的成员,常在地面用四肢灵活行走。
12、长腿蝠科(筒耳蝠科),仅1属5种。分布于南美洲。体型较小,体长仅3~5.5厘米。两鼻孔接近,无鼻叶;耳朵大而呈漏斗型,有厚而弯曲的耳屏。四肢和尾均细长,尾被尾膜所包裹。雄蝠额头上有一个鳞茎状的分泌腺,其功能不明。食虫性,居住在多岩洞地区。
13、烟蝠科(狂翼蝠科),仅2属2种。分布于中美洲到南美洲西北部。体较小,体长约4~6厘米。拇指退化而包裹在翼膜中。无鼻叶,耳朵呈漏斗状,有小的耳屏。食虫性,居住在岩洞中。
14、吸足蝠科,仅1属1种,即吸足蝠。分布于马达加斯加岛。拇指和脚侧处特化为吸盘。耳朵尾巴均长,耳屏方型,和耳朵前缘相融合。与盘翼蝠形态和习性相似,是趋同近化的结果。
15、蝙蝠科,有36属316种,分为5亚科:彩蝠亚科、蝙蝠亚科、管鼻蝠亚科、长翼蝠亚科、裂豆蝠亚科。有耳屏,无鼻叶,但有些种类有褶皱,尾通常被尾膜包裹。多为食虫性,个别种食鱼。分布于较寒冷地区的种类有冬眠或者迁徙的习性。
16、短尾蝠科(髭蝠科),仅1属2种分布于新西兰。其中强壮短尾蝠已灭绝,现仅存短尾蝠(髭蝠)。嘴上有浓密的触须,尾部短,耳朵大,耳屏长而狭窄。是所有蝙蝠中最常在地面活动的种类,可以灵活的用四肢在地面行走。食虫,也食果实和花蜜。
17、犬吻蝠科,有12属79种。广布于世界热带、亚热带地区,少数分布在温带。吻宽阔,有些种类嘴唇有褶皱,没有鼻叶。尾长,部分露于尾膜之外,略似鼠尾。翅膀扇动频率比其他多数蝙蝠更快,飞行迅速。多数1653种类高度群居性,结成大群居住在岩洞、树洞甚至建筑物中。
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