1、性质不同：胚乳是被子植物在双受精过程中精子与极核融合后形成的滋养组织。子叶为暂时性的叶性器官，数目在被子植物中相当稳定，成熟胚只有一片子叶。
2、作用不同：子叶的作用是使内胚乳中储藏的养料用于幼植物的发育，但有时也充当储藏或光合作用器官。胚乳的主要功能是为发育中的胚提供营养。
3、贮藏物质：胚乳的贮藏物质主要是碳水化合物，蛋白质，半纤维素，脂肪和油脂。碳水化合物的基本贮藏形式为淀粉。子叶则不是。
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